로제타폴드(RoseTTAFold)는 2021년 워싱턴대학교 데이비드 베이커·백민경 등 연구진이 공개한 심층학습 기반 단백질 구조 예측 모델임. 아미노산 서열, 잔기 간 거리·관계, 3차원 좌표의 세 종류 정보를 상호 교환하는 ‘3트랙’ 신경망을 이용해 단백질 구조와 복합체 상호작용을 예측함. 학계에 코드와 모델이 공개되면서 단백질 구조 예측 연구의 접근성을 높인 사례임.
관련 연구는 2023년 RFdiffusion을 통해 단백질 구조를 단순히 예측하는 작업에서 원하는 기능의 단백질 구조를 새로 설계하는 방향으로 발전했으며, 2024년 RoseTTAFold All-Atom은 핵산·소분자·금속 등이 포함된 복합 분자 모델링까지 확장함. 2025년 공개된 RFdiffusion2는 원자 수준의 반응 중심 구조를 바탕으로 새로운 효소를 설계하는 방법을 제시함. 원래의 RoseTTAFold, 이를 바탕으로 발전한 설계 모델, 베이커의 2024년 노벨 화학상 수상은 관련되지만 동일한 성과로 혼동하지 않아야 함.
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2021년 2025년
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2021 2건
2021년 6월 milestone 베이커 연구진, RoseTTAFold 논문 bioRxiv 사전공개 데이비드 베이커 연구진이 RoseTTAFold를 기술한 논문을 동료 평가 전 사전 출판물로 bioRxiv에 게시함. 아미노산 서열·잔기 간 상호작용·3차원 구조의 세 정보 흐름을 동시에 처리하는 3트랙 신경망으로 단백질 구조와 상호작용을 예측하는 방법을 제시. 정식 게재에 앞서 방법론을 공개해 학계의 단백질 구조 예측 도구 확산을 앞당긴 출발점. 백민경, 단백질 디자인 연구소 출처 1 · 월2021-07-15 release 베이커 연구진, RoseTTAFold 공개 데이비드 베이커 연구진(주도: 백민경)이 서열·잔기 간 상호작용·3차원 구조를 동시에 고려하는 3트랙 신경망 RoseTTAFold를 공개하고 《Science》에 발표. 단일 게이밍 컴퓨터에서 약 10분 만에 구조를 계산할 만큼 빠르고, 코드와 웹 서버를 개방해 누구나 사용할 수 있게 함. 알파폴드2와 함께 딥러닝 기반 구조 예측을 대중화한 핵심 성과. 단백질 구조 예측 출처 22023 2건
2023-07-11 milestone 베이커 연구진, 단백질 생성 모델 RFdiffusion 논문 발표 로제타폴드 구조 예측 신경망을 단백질 구조의 잡음을 제거하는 생성 모델로 재학습한 RFdiffusion 연구가 《Nature》에 온라인 공개됨. 연구진은 단백질 결합체, 대칭 복합체, 금속 결합 단백질 등의 설계 성과를 제시해 구조를 읽는 기술에서 새로운 분자 구조를 만드는 기술로 발전하는 경로를 입증함. 출처 12023-10-30 release 베이커 연구진, RoseTTAFold·RFdiffusion 전 원자 버전 공개 베이커 연구진이 RoseTTAFold와 단백질 생성 모델 RFdiffusion의 전 원자(all-atom) 확장 연구를 소개함. 단백질뿐 아니라 핵산, 소분자, 금속을 포함한 생체분자 복합체를 같은 계산 틀로 다루는 것을 목표로 했으며, 기존 단백질 구조 예측에서 보다 복잡한 분자 상호작용 모델링으로 넓어지는 전환을 보여줌. 로제타폴드 올아톰, 단백질 디자인 연구소 출처 22024 2건
2024년 3월 milestone 베이커 연구진, RoseTTAFold All-Atom 논문 Science 게재 RoseTTAFold All-Atom을 기술한 논문이 동료 평가를 거쳐 Science에 정식 게재됨. 단백질·핵산·소분자·금속과 공유 결합 변형까지 아우르는 일반화된 생체 분자 모델링·설계 방법을 제시. RoseTTAFold 계열이 단백질 구조 예측 도구에서 폭넓은 생체 분자 설계 플랫폼으로 자리잡았음을 보인 성과. 로제타폴드 올아톰, 단백질 디자인 연구소 출처 22024-10-09 milestone 스웨덴 왕립과학원, 베이커·허사비스·점퍼를 노벨 화학상 수상자로 선정 스웨덴 왕립과학원이 데이비드 베이커에게 계산 단백질 설계 공로로 2024년 노벨 화학상 절반을, 데미스 허사비스와 존 점퍼에게 단백질 구조 예측 공로로 나머지 절반을 공동 수여하기로 발표함. 로제타폴드의 연구 계보를 이해하는 데 의미 있는 사건이나, 로제타폴드 단독 연구만을 수상 이유로 적는 것은 정확하지 않음. 알파폴드, 데미스 허사비스+3 출처 12025 1건
2025-12-03 milestone 베이커 연구진, 효소 활성부위를 원자 수준에서 설계하는 RFdiffusion2 논문 공개 연구진이 반응에 필요한 기능기의 공간 배치를 입력으로 새로운 효소 골격을 설계하는 RFdiffusion2를 《Nature Methods》에 온라인 공개함. 다양한 41개 활성부위 벤치마크에서 기존 모델보다 높은 구조 설계 성능을 보고하고 일부 설계 효소의 실제 활성을 확인했으나, 천연 효소와 같은 수준의 활성이 일반적으로 확보된 것은 아니라고 설명함. 논문의 권호는 2026년 1월호임. 출처 1갱신 2026-10-29